基因組學(xué)技術(shù)服務(wù)

服務(wù)背景：

隨著自然科學(xué)領(lǐng)域?qū)�基因組學(xué)探索的深入及由其催生的蛋白質(zhì)組學(xué)、生物信息學(xué)及系統(tǒng)生物學(xué)等重要學(xué)科的發(fā)展，給整個(gè)生命科學(xué)的研究帶來(lái)了前所未有的機(jī)遇和挑戰(zhàn)�；�因組學(xué)作為其中一個(gè)重要組成部分，有著廣闊的發(fā)展空間。目前我國(guó)基因組學(xué)的研究尚無(wú)完整、長(zhǎng)期的規(guī)劃，很多科研工作尚處在起步階段。如何充分利用我國(guó)豐富的微生物資源和已有的基因組學(xué)研究成果，深入開(kāi)展微生物基因組研究，以滿(mǎn)足國(guó)家在能源、環(huán)境、人口健康與醫(yī)藥、生物新材料、農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域的戰(zhàn)略需求是我們面臨的重大課題。為適應(yīng)生命科學(xué)發(fā)展的市場(chǎng)需求，我公司建立起一個(gè)包括基因克隆、模板制備與檢測(cè)、測(cè)序及分析等技術(shù)領(lǐng)域的高水平人員梯隊(duì)和一個(gè)設(shè)施齊全、技術(shù)先進(jìn)的實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，并形成了一整套高效、完善的標(biāo)準(zhǔn)化實(shí)驗(yàn)流程和工作制度，具備各類(lèi)樣品的DNA提取和純化、PCR擴(kuò)增、DNA模板質(zhì)量檢測(cè)、DNA序列測(cè)定和分析的能力。

技術(shù)實(shí)力：

我公司基因組學(xué)實(shí)驗(yàn)室現(xiàn)已經(jīng)完成了兩株細(xì)菌的全基因組測(cè)序，與美國(guó)夏威夷大學(xué)合作進(jìn)行“木瓜全基因組測(cè)序計(jì)劃”，該計(jì)劃是我國(guó)科學(xué)界繼人類(lèi)基因組和超級(jí)雜交水稻全基因組后參與的第三個(gè)大型基因組的破譯。結(jié)合生物信息學(xué)平臺(tái)提供的技術(shù)支持，還可進(jìn)行引物設(shè)計(jì)、序列拼接和修改以及序列比對(duì)、基因注釋等進(jìn)一步的分析工作�？梢詫�(shí)現(xiàn)每天7000份質(zhì)粒DNA的提取、純化和檢測(cè)，500份PCR樣品的膠回收純化以及800個(gè)測(cè)序反應(yīng)。

基因組學(xué)服務(wù)項(xiàng)目：

服務(wù)內(nèi)容 備注 完成時(shí)間

測(cè)序 客戶(hù)提供質(zhì)粒、菌液 3-5天

菌株培養(yǎng)及質(zhì)粒純化 客戶(hù)提抗性、插入片段長(zhǎng)度等信息 2天

PCR 擴(kuò)增 客戶(hù)提供有關(guān)樣品來(lái)源及DNA提取詳細(xì)信息 3天

PCR 反應(yīng) 客戶(hù)提供模板、引物 2天

DNA提取 客戶(hù)提供組織、血液等樣本 3天

PCR 產(chǎn)物純化 客戶(hù)提供PCR原液 2-3天

分子克�。≒CR產(chǎn)物） 根據(jù)客戶(hù)需要對(duì)小片段及大片段PCR產(chǎn)物連載體建克隆 12天

引物設(shè)計(jì) 根據(jù)客戶(hù)樣品要求設(shè)計(jì)試驗(yàn)用引物 3天

設(shè)計(jì)制備載體 根據(jù)客戶(hù)樣品要求設(shè)計(jì)下步試驗(yàn)所需載體 1-2天

特殊引物的合成 客戶(hù)提供引物序列 3天

Email提供測(cè)序報(bào)告 報(bào)告包括一份測(cè)序彩圖，一份序列


通用引物 M13(F20)、M13(R27)、M13(F40)、M13(F41) 、T7 promoter、Sp6 promoter，其他常用引物根據(jù)客戶(hù)需求將逐步增加。


定量ＰＣＲ SYBR Green:客戶(hù)需提供模板、引物：Taqman:客戶(hù)需提供模板、引物、水解探針、表準(zhǔn)品 3-5 天

測(cè)序服務(wù)保障：

1.時(shí)間保障：通常情況下，3－5個(gè)工作日內(nèi)通過(guò)E-mail發(fā)送測(cè)序結(jié)果（大量樣品除外），隨后可根據(jù)客戶(hù)需要提供打印的測(cè)序報(bào)告單、彩色峰形圖譜和序列文件（收費(fèi)項(xiàng)目）。如服務(wù)中途出現(xiàn)意外影響完成日期，我們會(huì)提前通知您。
2.質(zhì)量結(jié)果保障：測(cè)序結(jié)果，正常情況下一次測(cè)序的長(zhǎng)度不低于 500bp ，通常達(dá) 700bp 以上。 通常從 20-30bp以后到大約500bp之間的序列是很可靠的，其余序列只能作為參考。序列以峰型圖為準(zhǔn)。保證每一個(gè)反應(yīng)提供不低于500bp的序列及相關(guān)信息；由于樣品種類(lèi)不同，測(cè)序的難度也不同，對(duì)于無(wú)法判讀的序列，我們保證進(jìn)行重復(fù)試驗(yàn)，若仍然無(wú)法讀出序列，則免收測(cè)序費(fèi)用。由于DNA結(jié)構(gòu)上的原因造成的測(cè)序失敗我們要正常收費(fèi)；查看測(cè)序報(bào)告的常用生物軟件有Chromas、DNAStar等。

測(cè)序服務(wù)結(jié)果說(shuō)明：

由于樣品種類(lèi)不同，測(cè)序的難度也不同，對(duì)于無(wú)法判讀的序列，我們保證進(jìn)行重復(fù)試驗(yàn)，若仍然無(wú)法讀出序列，則免收測(cè)序費(fèi)用；由于目前測(cè)序方法的局限，測(cè)序引物后10bp—40bp不一定準(zhǔn)確，500bp后僅供參考；由于DNA結(jié)構(gòu)上的原因造成的測(cè)序失敗我們要正常收費(fèi)；查看測(cè)序報(bào)告的常用生物軟件有Chromas、DNAStar等。

基因組學(xué)技術(shù)服務(wù)設(shè)備 ：

儀器名稱(chēng)及型號(hào) 制造商

DNA Sequence Analyzer 3730 Applied Biosystems

Real Time PCR System Applied Biosystems

P/ACEMDQ Capillary Electrophoresis System Beckman Coulter

SpectraMAX190 Molecular Devices

DUSeriers640 UV/VIS Spectrophotometers Beckman Coulter

Microplate Manager Bio-Rad


我公司基因組學(xué)實(shí)驗(yàn)室技術(shù)人員經(jīng)過(guò)兩年多的反復(fù)實(shí)踐，在專(zhuān)業(yè)科技帶頭人的指導(dǎo)下， 探索出適用于A(yíng)BI3730測(cè)序儀的測(cè)序反應(yīng)模式、PCR產(chǎn)物克隆及純化方法，在發(fā)揮了該測(cè)序儀在長(zhǎng)度和可靠性方面的優(yōu)勢(shì)的同時(shí)保證了測(cè)序質(zhì)量。