該技術(shù)采用4種或8種同位素的標(biāo)簽,通過特異性標(biāo)記多肽的氨基基團(tuán),然后進(jìn)行串聯(lián)質(zhì)譜分析,可同時比較4種或8種不同樣品中蛋白質(zhì)的相對含量。
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產(chǎn)品定義
iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)技術(shù)是由美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司ABI研發(fā)的一種多肽體外標(biāo)記技術(shù)。該技術(shù)采用4種或8種同位素的標(biāo)簽,通過特異性標(biāo)記多肽的氨基基團(tuán),然后進(jìn)行串聯(lián)質(zhì)譜分析,可同時比較4種或8種不同樣品中蛋白質(zhì)的相對含量。
技術(shù)原理
iTRAQ試劑由三部分組成:報告基團(tuán)、質(zhì)量平衡基團(tuán)和肽反應(yīng)標(biāo)記試劑基團(tuán),形成4種或8種相對分子質(zhì)量均等量(145或305)的異位標(biāo)簽。
iTRAQ試劑組成圖(以4-plex為例)
iTRAQ試劑用于標(biāo)記酶解后的肽段。在質(zhì)譜圖中,任何一種iTRAQ試劑標(biāo)記的不同樣本中的同一肽段表現(xiàn)為相同的質(zhì)荷比。在串聯(lián)質(zhì)譜中,報告基團(tuán)、質(zhì)量平衡基團(tuán)和多肽反應(yīng)基團(tuán)之間的鍵斷裂,質(zhì)量平衡基團(tuán)丟失,帶不同同位素標(biāo)簽的同一多肽產(chǎn)生不同的報告離子,根據(jù)報告離子的信號強度值可獲得樣品間相同肽段的定量信息,再經(jīng)過軟件處理得到蛋白質(zhì)的定量信息。
實驗流程
注釋:“樣品及實驗預(yù)判”包括定量、SDS-PAGE測試、酶解和質(zhì)譜分析,對樣品質(zhì)量及樣品之間的平行性進(jìn)行初步判斷。
使用儀器
Thermo Scientific Q Exactive AB Sciex TripleTOFTM 5600
技術(shù)優(yōu)勢
可同時對2-8種不同條件樣品進(jìn)行蛋白質(zhì)差異分析。
適合廣泛樣品類型:胞漿蛋白、膜蛋白、核蛋白、胞外蛋白等。
與凝膠分離的蛋白質(zhì)定量技術(shù)相比,iTRAQ質(zhì)譜定量技術(shù)可檢測到更多類型的蛋白質(zhì)分子,如低豐度蛋白質(zhì)、強酸(堿)性蛋白質(zhì)、<10KD或>100KD的蛋白質(zhì)分子。
應(yīng)用領(lǐng)域
疾病標(biāo)志物篩選 作用機制研究
植物抗逆研究 藥物作用靶點研究
特殊功能蛋白質(zhì)篩選
樣品要求
樣品類型 |
樣品要求(/組樣品) |
蛋白質(zhì)提取物 |
濃度 >1μg/μl,蛋白質(zhì)總量 >300μg |
細(xì)胞樣品 |
細(xì)胞量>107 |
組織樣品 |
動物、微生物組織濕重>10mg;植物鮮嫩組織>100mg |
體液樣品 |
血液體積>500μl |
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