DNA pull-down是
體外研究DNA與蛋白互作的有力工具。該技術(shù)將
生物素標(biāo)記的DNA片段結(jié)合在
鏈霉親和素磁珠上,再與細(xì)胞核蛋白孵育,
純化出與DNA片段互作的蛋白,
洗滌洗脫得到的
蛋白產(chǎn)物,做
Western-blot檢測特定蛋白是否與靶DNA片段結(jié)合;做
質(zhì)譜鑒定即可篩選出與DNA片段可能互作的蛋白信息(如:轉(zhuǎn)錄因子、組蛋白等)。
RNA pull down是
體外研究RNA與蛋白互作的重要技術(shù)。該技術(shù)是用
生物素標(biāo)記體外轉(zhuǎn)錄的靶RNA分子,再用
鏈霉親和素純化出與靶RNA結(jié)合的蛋白復(fù)合體,洗脫得到
RNA結(jié)合蛋白質(zhì)。再通過
western blot實(shí)驗(yàn)檢測特定的RNA結(jié)合蛋白是否與靶RNA結(jié)合;或通過
質(zhì)譜儀檢測可以篩選出與靶RNA結(jié)合的蛋白。
GST pull-down技術(shù)是一種體外驗(yàn)證或篩選互作蛋白的技術(shù)。該技術(shù)將"誘餌"蛋白與一種易于純化的配體標(biāo)簽(如:GST標(biāo)簽)進(jìn)行融合表達(dá),而帶標(biāo)簽的誘餌蛋白能被特異結(jié)合該標(biāo)簽的固相親和配基捕獲,形成"次級(jí)親和支持物",用于純化與誘餌蛋白相互作用的其他蛋白。純化產(chǎn)物洗脫后,經(jīng)Western blot驗(yàn)證或LC-MS/MS,即鑒定與誘餌蛋白互作的蛋白。
GST pull-down。bio-equip.com
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