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一種基于LC-MS/MS的靶向蛋白質(zhì)分析技術(shù)，能夠?qū)δ繕?biāo)蛋白、目標(biāo)肽段（包括發(fā)生翻譯后修飾的肽段）進(jìn)行高選擇性、特異性、重復(fù)性和準(zhǔn)確性檢測，從而實現(xiàn)對目標(biāo)蛋白/肽段的相對或絕對定量分析
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PRM（平行反應(yīng)監(jiān)測，parallel reaction monitoring）是一種基于LC-MS/MS的靶向蛋白質(zhì)分析技術(shù)，能夠?qū)δ繕?biāo)蛋白、目標(biāo)肽段（包括發(fā)生翻譯后修飾的肽段）進(jìn)行高選擇性、特異性、重復(fù)性和準(zhǔn)確性檢測，從而實現(xiàn)對目標(biāo)蛋白/肽段的相對或絕對定量分析。
▶ 對目標(biāo)蛋白質(zhì)/肽段進(jìn)行相對或者絕對定量檢測
▶ 疾病標(biāo)志物靶向檢測
▶ 靶向藥物的開發(fā)
▶ 生物通特定信號通路研究
數(shù)據(jù)分析
▶ 通量高：可檢測多達(dá)100個目標(biāo)蛋白質(zhì)，節(jié)省樣本集實驗成本
▶ 定量能力強(qiáng)：靈敏度可達(dá)ppm級別，線性范圍可達(dá)5-6個數(shù)量級
▶ 特異性高：可精細(xì)區(qū)分亞型、修飾位點、突變位點等精細(xì)序列差異
參考文獻(xiàn)
1.Large-scale proteomic analysis of Alzheimer's disease brain and cerebrospinal fluid reveals early changes in energy metabolism associated with microglia and astrocyte activation. Nat Med. 2020.
TMT蛋白質(zhì)組+PRM靶向驗證-人腦組織+腦脊液-通過對大規(guī)模群體進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)檢測，并采用WGCNA分析挖掘AD關(guān)鍵蛋白模塊（包括能量代謝），揭示能量代謝紊亂對阿爾茨海默病早期功能障礙的重要影響
2.Circulating proteomic panels for diagnosis and risk stratification of acute-on-chronic liver failure in patients with viral hepatitis B. Theranostics. 2019.
蛋白質(zhì)組學(xué)+PRM靶向蛋白組學(xué)-人血漿-通過“篩選-驗證”的思路，挖掘了大量HBV-ACLF相關(guān)候選標(biāo)志物，開發(fā)了慢加急性肝衰竭ACLF臨床治療中診斷及預(yù)后血漿蛋白標(biāo)志物組合的研究
3.Mutations in RABL3 alter KRAS prenylation and are associated with hereditary pancreatic cancer. Nat Genet. 2019.
PRM靶向蛋白組學(xué)-斑馬魚胰腺\肝臟-確定了RABL3突變作為癌癥家族基因檢測的靶點，并揭示了在發(fā)育和癌癥中RAS活性失調(diào)的機(jī)制
實驗流程
PRM技術(shù)分析原理
應(yīng)用方向
▶ 蛋白質(zhì)組結(jié)果驗證▶ 對目標(biāo)蛋白質(zhì)/肽段進(jìn)行相對或者絕對定量檢測
▶ 疾病標(biāo)志物靶向檢測
▶ 靶向藥物的開發(fā)
▶ 生物通特定信號通路研究
數(shù)據(jù)分析
| 標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)分析 | |
| 圖譜 | 目標(biāo)肽段離子圖譜 |
| 定量差異分析 | 目標(biāo)肽段PRM定量原始結(jié)果 |
| 目標(biāo)肽段和蛋白的定量結(jié)果 | |
| t test等單維統(tǒng)計學(xué)分析 | |
技術(shù)優(yōu)勢
▶ 適用性廣：無物種限制▶ 通量高：可檢測多達(dá)100個目標(biāo)蛋白質(zhì)，節(jié)省樣本集實驗成本
▶ 定量能力強(qiáng)：靈敏度可達(dá)ppm級別，線性范圍可達(dá)5-6個數(shù)量級
▶ 特異性高：可精細(xì)區(qū)分亞型、修飾位點、突變位點等精細(xì)序列差異
參考文獻(xiàn)
TMT蛋白質(zhì)組+PRM靶向驗證-人腦組織+腦脊液-通過對大規(guī)模群體進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)檢測，并采用WGCNA分析挖掘AD關(guān)鍵蛋白模塊（包括能量代謝），揭示能量代謝紊亂對阿爾茨海默病早期功能障礙的重要影響
2.Circulating proteomic panels for diagnosis and risk stratification of acute-on-chronic liver failure in patients with viral hepatitis B. Theranostics. 2019.
蛋白質(zhì)組學(xué)+PRM靶向蛋白組學(xué)-人血漿-通過“篩選-驗證”的思路，挖掘了大量HBV-ACLF相關(guān)候選標(biāo)志物，開發(fā)了慢加急性肝衰竭ACLF臨床治療中診斷及預(yù)后血漿蛋白標(biāo)志物組合的研究
3.Mutations in RABL3 alter KRAS prenylation and are associated with hereditary pancreatic cancer. Nat Genet. 2019.
PRM靶向蛋白組學(xué)-斑馬魚胰腺\肝臟-確定了RABL3突變作為癌癥家族基因檢測的靶點，并揭示了在發(fā)育和癌癥中RAS活性失調(diào)的機(jī)制
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