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蛋白修飾表達譜分析
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隨著質(zhì)譜技術(shù)的靈敏度和分辨率的提高，樣本分離分級方法進一步優(yōu)化，PTM的測序深度不斷增加。單就磷酸化而言，深度測序技術(shù)在人類、擬南芥等生物中已可堅定到6萬多個修飾位點。而在其他PTM上的表達譜研究也不斷刷新著研究者們的已有認(rèn)知。這無不向我們展示出PTM表達譜巨大的研究潛力。
▶ 磷酸化：信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞周期、生長發(fā)育及癌癥機理等；
▶ 糖基化：蛋白質(zhì)折疊、更新以及免疫應(yīng)答等；
▶ 乙�；夯虮磉_調(diào)控、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞代謝、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性以及神經(jīng)退行性病變等；
▶ 泛素化：細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA修復(fù)以及信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等；
▶ 甲基化：染色質(zhì)結(jié)構(gòu)及轉(zhuǎn)錄調(diào)控等；
▶ 丙�；� / 丙二�；� / 戊二酰化 / 琥珀�；褐饕嬖谟诰�粒體和細(xì)菌中，與代謝過程密切相關(guān)。
▶ 鑒定通量高，可檢測高達2.5萬+個磷酸化修飾位點
磷酸化修飾蛋白譜+蛋白組+轉(zhuǎn)錄組繪制擬南芥蛋白質(zhì)組草圖
2.Proteome-wide identification and functional analysis of ubiquitinated proteins in peach leaves.2020.Scientific Reports. (IF 4.379) 【客戶文獻】
泛素化蛋白譜揭示泛素化在作物不同生理階段中的作用
3.N-glycosylation proteomic characterization and cross-species comparison of milk fat globule membrane proteins from mammals. 2016. Proteomics. (IF 3.984) 【客戶文獻】
構(gòu)建哺乳動物乳汁脂肪球膜蛋白N-糖基化表達譜
實驗流程
應(yīng)用方向
生物領(lǐng)域各個研究方面，如：▶ 磷酸化：信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞周期、生長發(fā)育及癌癥機理等；
▶ 糖基化：蛋白質(zhì)折疊、更新以及免疫應(yīng)答等；
▶ 乙�；夯虮磉_調(diào)控、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞代謝、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性以及神經(jīng)退行性病變等；
▶ 泛素化：細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA修復(fù)以及信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等；
▶ 甲基化：染色質(zhì)結(jié)構(gòu)及轉(zhuǎn)錄調(diào)控等；
▶ 丙�；� / 丙二�；� / 戊二酰化 / 琥珀�；褐饕嬖谟诰�粒體和細(xì)菌中，與代謝過程密切相關(guān)。
數(shù)據(jù)分析
| 表 | 圖 |
| 蛋白質(zhì)鑒定列表 | 修飾位點統(tǒng)計繪圖 |
| 修飾位點鑒定列表 | GO功能富集圖 |
| 肽段保守motif分析列表 | KEGG通路圖 |
| GO功能列表 | 保守motif分析 |
| KEGG信號通路Mapping表 | 蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)分析 |
技術(shù)優(yōu)勢
▶ 采用CST金標(biāo)抗體富集，特異性高，結(jié)果可靠▶ 鑒定通量高，可檢測高達2.5萬+個磷酸化修飾位點
參考文獻
1.Mass-spectrometry-based draft of the Arabidopsis proteome. 2020.Nature. (IF 49.962)磷酸化修飾蛋白譜+蛋白組+轉(zhuǎn)錄組繪制擬南芥蛋白質(zhì)組草圖
2.Proteome-wide identification and functional analysis of ubiquitinated proteins in peach leaves.2020.Scientific Reports. (IF 4.379) 【客戶文獻】
泛素化蛋白譜揭示泛素化在作物不同生理階段中的作用
3.N-glycosylation proteomic characterization and cross-species comparison of milk fat globule membrane proteins from mammals. 2016. Proteomics. (IF 3.984) 【客戶文獻】
構(gòu)建哺乳動物乳汁脂肪球膜蛋白N-糖基化表達譜
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