次生代謝產(chǎn)物(Secondary metabolites)是不直接涉及到生命正常生長、發(fā)育或繁殖的有機化合物,次生代謝產(chǎn)物在植物中起著重要的作用,與抵御病蟲害及應對環(huán)境脅迫密切相關。次生代謝產(chǎn)物主要包含:生物堿、黃酮類、萜類、糖苷類等。部分次級代謝產(chǎn)物可以作為藥物、調(diào)味品或藥物。本方法利用基于高分辨質(zhì)譜的LC-MS非靶向代謝組技術(shù),建立了龐大的初級代謝物和次生代謝物的數(shù)據(jù)庫,通過“MS1+MS2+RT”或“MS1+MS2”的方式輔助人工譜圖解析對代謝物進行鑒定,助力植物代謝組學研究。
實驗流程
送樣建議
樣本類型 |
常規(guī)送樣量 |
最低送樣量 |
建議生物學重復 |
植物組織 |
≥400 mg |
≥200 mg |
重復數(shù)≥6 |
水培分泌物 |
≥10 mL(可自行提前冷凍濃縮) |
≥5 mL(可自行提前冷凍濃縮) |
其他樣本 |
請另外咨詢 |
備注:根系分泌物等類似樣本因為代謝物濃度低,客戶可自行取等量體積凍干之后寄送給我們,以便得到更好的實驗結(jié)果
應用方向
生物領域各個研究方面,如:
▶ 植物次生代謝物活性成分鑒定
▶ 植物抗病蟲害、抗逆研究
數(shù)據(jù)分析
分析類型 |
分析內(nèi)容 |
質(zhì)控 |
TIC、QC等多項 |
差異分析 |
單變量統(tǒng)計分析(火山圖等) |
多維統(tǒng)計分析(PCA、PLSDA、OPLSDA)等 |
功能分析 |
層次聚類分析 |
相關性分析 |
KEGG分析 |
高級生信分析 |
回歸分析 |
趨勢聚類分析 |
技術(shù)優(yōu)勢
▶ 實測定性數(shù)目多:均定性數(shù)目在800+
▶ 物質(zhì)種類多:包含生物堿、黃酮類、萜類、糖苷類等眾多次級代謝物和初級代謝產(chǎn)物
▶ 鑒定準確:QE高分辨質(zhì)譜,嚴格譜圖匹配標準(MS1,MS2,RT,人工譜圖解析)
▶ 嚴格質(zhì)控:多項嚴格QC系統(tǒng),保證定性定量結(jié)果最優(yōu)
參考文獻
1.Identification and Mode of Inheritance of Quantitative Trait Loci for Secondary Metabolite Abundance in Tomato. Plant Cell. 2015.
植物次生代謝組-番茄-番茄次生代謝產(chǎn)物和性狀位點的鑒定及遺傳模式研究
2.Primary transcript of miR858 encodes regulatory peptide and controls flavonoid biosynthesis and development in Arabidopsis. Nature Plants. 2020.
植物次生代謝組-擬南芥- miR858的初級轉(zhuǎn)錄物編碼調(diào)控肽控制擬南芥類黃酮的合成
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