土壤中的代謝物主要來(lái)自于植物根際分泌物及微生物對(duì)有機(jī)質(zhì)的降解。土壤微生物的代謝活動(dòng)對(duì)生物殘?bào)w的分解、土壤結(jié)構(gòu)形成、有機(jī)物轉(zhuǎn)化、有毒物質(zhì)的降解等過(guò)程有至關(guān)重要的作用。另一方面也有研究表明,植物根際分泌物可以調(diào)節(jié)與根際微生物的互作關(guān)系。對(duì)土壤中的代謝物進(jìn)行檢測(cè)分析,對(duì)于土壤菌落功能、環(huán)境毒理、植物環(huán)境互作、土壤質(zhì)量評(píng)價(jià)等方向研究具有重要意義。
產(chǎn)品定義
利用基于LC-MS的非靶向代謝組學(xué)方法對(duì)土壤中的代謝物進(jìn)行定性和相對(duì)定量分析。
實(shí)驗(yàn)流程
數(shù)據(jù)分析
分析類型 |
分析內(nèi)容 |
質(zhì)控 |
TIC、QC等多項(xiàng) |
輪廓分析 |
Superclass分類 |
差異分析 |
單變量統(tǒng)計(jì)分析(火山圖等) |
多維統(tǒng)計(jì)分析(PCA、PLSDA、OPLSDA)等 |
功能分析 |
層次聚類分析 |
相關(guān)性分析 |
KEGG分析 |
高級(jí)生信分析 |
WGCNA分析 |
回歸分析 |
趨勢(shì)聚類分析 |
機(jī)器學(xué)習(xí) |
參考文獻(xiàn)
1.Song Y , Li X , Yao S , et al. Correlations between soil metabolomics and bacterial community structures in the pepper rhizosphere under plastic greenhouse cultivation[J]. Science of The Total Environment, 2020, 728:138439.
2.Li X , Song Y , Bian Y , et al. Insights into the mechanisms underlying efficient Rhizodegradation of PAHs in biochar-amended soil: From microbial communities to soil metabolomics[J]. Environment International, 2020, 144:105995.
3.Li X , Qu C , Bian Y , et al. New insights into the responses of soil microorganisms to polycyclic aromatic hydrocarbon stress by combining enzyme activity and sequencing analysis with metabolomics[J]. Environmental Pollution, 2019, 255:113312.
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