糖類是自然界中廣泛分布的一類重要的有機化合物,是一切生命體維持生命活動所需能量的主要來源,在生命活動過程中起著重要的作用。植物中最重要的多糖是淀粉和纖維素,動物細胞中最重要的多糖是糖原。最終多糖會被分解,并以單糖的形式被生物體代謝供能或者轉(zhuǎn)化為其它成分。本方法利用基于LC-MS的靶向代謝組方法對糖類的8種單糖物質(zhì)進行絕對定量分析。
檢測指標
編號 |
代謝物名稱 |
Metabolites |
1 |
D-Mannose |
甘露糖 |
2 |
D-Ribose |
核糖 |
3 |
L-rhamnose monohydrate |
鼠李糖 |
4 |
D-Galactose |
半乳糖 |
5 |
Glucose |
葡萄糖 |
6 |
L-Arabinose |
阿拉伯糖 |
7 |
D-Xylose |
木糖 |
8 |
L-Fucose |
巖藻糖 |
實驗流程
應(yīng)用方向
生物領(lǐng)域多個研究方向,如
▶ 植物抗逆、生長發(fā)育、育種、果實營養(yǎng)品質(zhì)等相關(guān)研究;
▶ 糖代謝途徑研究;
▶ 糖生物活性研究;
▶ 生物標志物、藥物治療研究等。
數(shù)據(jù)分析
分析類型 |
分析內(nèi)容 |
擬解決問題 |
質(zhì)控 |
QC RSD |
獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù) |
差異分析 |
單變量統(tǒng)計分析t. test |
反應(yīng)每個代謝物的組間差異 |
箱線圖 |
反應(yīng)單個代謝物在組見的變化 |
功能分析 |
層次聚類分析 |
獲得代謝物的表達模式信息 |
KEGG分析 |
獲得相關(guān)代謝通路和生物學(xué)功能 |
高級生信分析 |
回歸分析 |
建立重要代謝物和其他指標的關(guān)聯(lián) |
趨勢聚類分析 |
探討代謝物的含量趨勢模式 |
機器學(xué)習(xí)ROC |
篩選診斷性能良好的生物標志物 |
技術(shù)優(yōu)勢
(1) 高靈敏度:基于LC-MS平臺檢測方法保證檢測靈敏度,精確定性、絕對定量;
(2) 適用性廣:支持細胞、組織、體液多種樣本類型;
(3) 嚴格質(zhì)控:多重質(zhì)控,標準品人工校對。
(4) 快速交付:16個工作日
送樣建議
樣本類型 |
常規(guī)送樣量 |
最低送樣量 |
建議生物學(xué)重復(fù) |
血(血清、血漿) |
≥200 μL |
≥100 μL |
臨床樣本:每組≥ 30 例
動物來源:每組≥ 10 例
植物來源:每組≥ 3 例
細胞樣本:每組≥ 6 例 |
尿液 |
≥200 μL |
≥100 μL |
動物組織 |
≥100 mg |
≥60 mg |
細胞 |
10^7 |
10^7 |
細胞上清 |
≥1mL |
≥500 μL |
細菌或真菌 |
沉淀濕重≥200 mg |
沉淀濕重≥100 mg |
發(fā)酵液 |
≥500 μL |
≥200 μL |
卵泡液、腦脊液、淋巴液等 |
≥200 μL |
≥100 μL |
植物組織 |
≥400 mg |
≥200 mg |
植物種子 |
≥400 mg |
≥200 mg |
其他特殊樣本 |
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參考文獻
1.Mardinoglu A , Alena Stanáková, Lotta L A , et al. Plasma Mannose Levels Are Associated with Incident Type 2 Diabetes and Cardiovascular Disease [J]. Cell Metabolism, 2017.
2.Sullivan W J , Mullen P J , Schmid E W , et al. Extracellular Matrix Remodeling Regulates Glucose Metabolism through TXNIP Destabilization[J]. Cell, 2018:S009286741831033X-.
3.Zeng T, Fang B, Huang F, Dai L, Tang Z, Tian J, Cao G, Meng X, Liu Y, Lei B, Lu M, Cai Z. Mass spectrometry-based metabolomics investigation on two different indica rice grains (Oryza sativa L.) under cadmium stress. Food Chem. 2021 May 1;343:128472.
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