海星生物定制的DNA甲基化標準品,重復性和穩(wěn)定性優(yōu)秀,填補了國內(nèi)缺少標準品的空白。
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DNA甲基化水平和模式的改變是腫瘤發(fā)生的一個重要因素,這些變化包括CpG島局部的高甲基化和基因組DNA低甲基化狀態(tài)。由于CpG島的局部高度甲基化要早于細胞惡性增生,故其甲基化的檢測可用于腫瘤的預測,而全基因組水平的低水平甲基化狀態(tài),則隨著腫瘤惡性程度的增加而進一步降低,使其可用于腫瘤的診斷以及分級。甲基化可作為腫瘤等早期診斷的生物標記物和預后評估指標,對腫瘤的篩查和風險評估、早期診斷、分期分型、預后判斷及治療檢測都有重要意義。
甲基化分析的方法主要有以下幾種:甲基化敏感性限制性內(nèi)切酶-PCR/Southern法(MSRE-PCR/Southern)、重亞硫酸鹽測序法(Bisulfite Sequencing)、甲基化熒光PCR法(MethyLight)、甲基化特異性PCR(MS-PCR)、焦磷酸測序等。
近幾年, NMPA批準的甲基化檢測試劑盒均為熒光PCR法,主要原因在于熒光PCR法操作簡便,無需在PCR后電泳,且具有靈敏度高、特異性強、重復性好等特點。其主要原理如下:先用重亞硫酸鹽處理待測DNA片段,設計一個能與待測位點區(qū)互補的探針,探針的5’端連接報告熒光,3’端連接淬滅熒光,隨后一般采用MSP引物進行實時定量PCR。但該方法多為單重PCR檢測,沒有內(nèi)參基因的擴增,不能確保模板DNA的硫化修飾質量。
根據(jù)NMPA官網(wǎng)數(shù)據(jù)顯示,目前甲基化檢測種類涉及septin9、SHOX2、RASSF1A、RNF180、SDC2、MGMT、BMP3、NDRG4等基因;涉及的檢測項目包括胃癌、結直腸癌、大腸癌、膠質瘤等癌種。海星生物基于腫瘤早篩熱門靶點,設置了低甲基化水平的陰性對照品和高甲基化水平的陽性對照品,適用于BSP、MethyLight、MS-PCR、焦磷酸測序等多種平臺的性能評估。樣本來源于人類細胞系,最大程度接近患者樣本,無倫理風險;質量高度穩(wěn)定,均一性好,可持續(xù)提供,批次穩(wěn)定,可溯源。海星生物所有Methylation標準品均經(jīng)過BSP法QC驗證,這種方法一度被認為是DNA甲基化分析的金標準,其過程如下:經(jīng)過亞硫酸氫鹽處理后,用PCR擴增目的片段,并對PCR產(chǎn)物進行測序,將序列與未經(jīng)處理的序列進行比較,判斷CpG位點是否發(fā)生甲基化。這種方法可靠,且精確度高,能明確目的片段中每一個CpG位點的甲基化狀態(tài)。
A基因低甲基化細胞株(2.1%, BSP驗證):
高甲基化細胞株(96.2%, BSP驗證):
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