技術(shù)介紹:
TMT™(Tandem Mass Tag™)技術(shù)是由Thermo Scientific公司研發(fā)的一種多肽標(biāo)記技術(shù)。 通過(guò)特異性標(biāo)記多肽的特定氨基基團(tuán),進(jìn)行串聯(lián)質(zhì)譜分析,TMTpro™ 16plex 同位素標(biāo)記試劑組可同時(shí)比較16個(gè)不同樣品中蛋白質(zhì)的相對(duì)含量,通過(guò)搭橋和批次效應(yīng)處理可實(shí)現(xiàn)上百例樣本間的蛋白質(zhì)相對(duì)含量比較。TMT標(biāo)記肽段通常采用DDA (Data-Dependent Acquisition) 模式采集、可進(jìn)行深度分級(jí)從而提高鑒定深度。
技術(shù)優(yōu)勢(shì):
1. 西湖歐米采用TMTpro™ 16plex 同位素標(biāo)記試劑組,通過(guò)設(shè)計(jì)上的優(yōu)化和批次效應(yīng)處理,可實(shí)現(xiàn)500例以內(nèi)樣本的蛋白質(zhì)相對(duì)含量的同時(shí)比較分析。
2. 通過(guò)進(jìn)行深度分級(jí)(30 Fraction)可以使組織樣本中的蛋白定量數(shù)量達(dá)到10000+、血液中的蛋白定量數(shù)達(dá)到1000+。
3. 結(jié)合PCT樣本前處理技術(shù),可以實(shí)現(xiàn)臨床微量樣本(如FFPE、穿刺活檢、淚液等)的高深度蛋白質(zhì)定量分析,組織樣本最低送樣量只需0.1mg。
合作項(xiàng)目案例:
項(xiàng)目案例1:Cell | TMT高深度分級(jí)解析新冠患者不同器官組織FFPE樣本中的蛋白組特征
FFPE樣本一直是十分重要的臨床樣本資源,但由于其樣本量較少難以開(kāi)展蛋白組學(xué)研究。該研究借助PCT微量樣本前處理技術(shù)和TMT標(biāo)記定量技術(shù),在19名COVID-19患者和56名通過(guò)手術(shù)感染其他疾病的非COVID-19病例的7 種不同器官組織的218個(gè)FFPE樣本中,量化了11394種蛋白質(zhì)。
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867421000040
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西湖歐米(杭州)生物科技有限公司創(chuàng)立于2020年7月,是一家專注于AI賦能的微觀世界數(shù)據(jù)公司。歐米致力于以蛋白質(zhì)組大數(shù)據(jù)技術(shù)創(chuàng)新為驅(qū)動(dòng)力,聯(lián)合多模態(tài)大數(shù)據(jù),助力精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)和藥物研發(fā)。西湖歐米凝聚了百余位具有生物、醫(yī)療、AI等不同學(xué)科背景的高素質(zhì)人才隊(duì)伍。