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PulseDIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)
PulseDIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)
服務(wù)類別:分子與細(xì)胞總訪問:232
最后更新:2023-8-18半年訪問:32
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技術(shù)介紹:
PulseDIA技術(shù)是西湖歐米的專利技術(shù),在傳統(tǒng)的DIA 技術(shù)的基礎(chǔ)上,將一個(gè)窗口根據(jù)質(zhì)荷比分割成更小范圍的多個(gè)窗口,并將這些窗口以脈沖的方式均勻分配至不同的質(zhì)譜方法進(jìn)行采集。同一個(gè)樣本分成多次短梯度進(jìn)樣,每次進(jìn)樣方法均有不同的質(zhì)譜窗口,最后合并分析幾次采集的質(zhì)譜數(shù)據(jù),達(dá)到更高的多肽和蛋白質(zhì)鑒定量。
 
技術(shù)優(yōu)勢(shì):
1. 西湖歐米專利技術(shù),在常規(guī)DIA的基礎(chǔ)上提升蛋白鑒定數(shù)量10%-30%;
2. 結(jié)合PCT樣本前處理技術(shù),可以實(shí)現(xiàn)臨床微量樣本(如FFPE、穿刺活檢、淚液等)的高深度蛋白質(zhì)定量分析,組織樣本最低送樣量只需0.1mg。
 
項(xiàng)目案例:
Mol Cell Proteomics | 深度DIA蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定慢性髓系白血病獲得性耐藥的靶向調(diào)節(jié)因子
為了解K562細(xì)胞對(duì)甲磺酸伊馬替尼(IMA)和阿霉素(ADR)耐藥的潛在機(jī)制,用低劑量IMA或ADR處理K562細(xì)胞2個(gè)月,根據(jù)耐藥指數(shù)的增加判斷其對(duì)藥物的輕、中、重度耐藥;赑ulseDIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)從數(shù)據(jù)集中總共鑒定和量化了98232種肽的7082種蛋白質(zhì)。發(fā)現(xiàn)Sirtuin信號(hào)通路在耐ADR和耐IMA的K562細(xì)胞中顯著富集。特別是,IDH2被確定為與耐藥表型相關(guān)的潛在藥物靶標(biāo)。

 
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