技術(shù)介紹:
PulseDIA技術(shù)是西湖歐米的專利技術(shù),在傳統(tǒng)的DIA 技術(shù)的基礎(chǔ)上,將一個(gè)窗口根據(jù)質(zhì)荷比分割成更小范圍的多個(gè)窗口,并將這些窗口以脈沖的方式均勻分配至不同的質(zhì)譜方法進(jìn)行采集。同一個(gè)樣本分成多次短梯度進(jìn)樣,每次進(jìn)樣方法均有不同的質(zhì)譜窗口,最后合并分析幾次采集的質(zhì)譜數(shù)據(jù),達(dá)到更高的多肽和蛋白質(zhì)鑒定量。
技術(shù)優(yōu)勢(shì):
1. 西湖歐米專利技術(shù),在常規(guī)DIA的基礎(chǔ)上提升蛋白鑒定數(shù)量10%-30%;
2. 結(jié)合PCT樣本前處理技術(shù),可以實(shí)現(xiàn)臨床微量樣本(如FFPE、穿刺活檢、淚液等)的高深度蛋白質(zhì)定量分析,組織樣本最低送樣量只需0.1mg。
項(xiàng)目案例:
Mol Cell Proteomics | 深度DIA蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定慢性髓系白血病獲得性耐藥的靶向調(diào)節(jié)因子
為了解K562細(xì)胞對(duì)甲磺酸伊馬替尼(IMA)和阿霉素(ADR)耐藥的潛在機(jī)制,用低劑量IMA或ADR處理K562細(xì)胞2個(gè)月,根據(jù)耐藥指數(shù)的增加判斷其對(duì)藥物的輕、中、重度耐藥;赑ulseDIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)從數(shù)據(jù)集中總共鑒定和量化了98232種肽的7082種蛋白質(zhì)。發(fā)現(xiàn)Sirtuin信號(hào)通路在耐ADR和耐IMA的K562細(xì)胞中顯著富集。特別是,IDH2被確定為與耐藥表型相關(guān)的潛在藥物靶標(biāo)。
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西湖歐米(杭州)生物科技有限公司創(chuàng)立于2020年7月,是一家專注于AI賦能的微觀世界數(shù)據(jù)公司。歐米致力于以蛋白質(zhì)組大數(shù)據(jù)技術(shù)創(chuàng)新為驅(qū)動(dòng)力,聯(lián)合多模態(tài)大數(shù)據(jù),助力精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)和藥物研發(fā)。西湖歐米凝聚了百余位具有生物、醫(yī)療、AI等不同學(xué)科背景的高素質(zhì)人才隊(duì)伍。