宏蛋白質(zhì)組學(Metaproteomics)是使用基于質(zhì)譜(MS)的蛋白質(zhì)組學來研究特定時刻下微生物群落的所有蛋白。這些群落可以是環(huán)境樣品的一部分(例如土壤,淤泥,廢水,海洋等)。
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宏蛋白質(zhì)組學(Metaproteomics)是使用基于質(zhì)譜(MS)的蛋白質(zhì)組學來研究特定時刻下微生物群落的所有蛋白。這些群落可以是環(huán)境樣品的一部分(例如土壤,淤泥,廢水,海洋等),也可以存在于宿主生物體內(nèi)(例如人的腸道,黏膜腔等)。
宏蛋白質(zhì)組分析的關(guān)鍵點之一的數(shù)據(jù)庫主要有兩種途徑獲得:
1)在公共數(shù)據(jù)庫中提取相應(yīng)物種序列數(shù)據(jù)庫用于分析
2)通過宏基因組等手段深度測序樣品中的物種序列作為參考序列
實驗流程
技術(shù)特點
應(yīng)用方向