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數據非依賴采集（data independent acquisition，DIA）是近年來受矚目的質譜采集技術之一，是定量蛋白質組學新發(fā)展。
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數據非依賴采集（data independent acquisition，DIA）是近年來受矚目的質譜采集技術之一，是定量蛋白質組學新發(fā)展。相比于DDA的優(yōu)勢在于高效測定復雜樣品中豐度極低的蛋白分子，極大地提高了定量分析的可信度。其原理是在質譜數據采集時，高速、循環(huán)的將每個采集窗口內的所有母離子及其子離子碎裂后進行全掃描，而非根據母離子信號強度篩選后進行二級碎片再掃描。因此DIA具有高通量、高分辨率、高可重現性、定量準確等優(yōu)點，而且樣本無需分級上機，極大的縮短了每個樣品的檢測時間，適合大樣本量的蛋白質組研究。但由于DIA獲得的是幾乎沒有丟失的所有離子信息，數據量及其復雜性大大增加，數據分析難度加大。
目前主流的數據分析是基于 DDA/DIA 構建的譜庫和實驗產生的 數據對樣品中的蛋白質進行鑒定和定量。公共的譜庫可以從各大蛋白質組研究數據平臺下載，但對于一些特異性的樣本，為了有更好的鑒定結果，還需要通過實驗樣本建立DDA參考數據庫。
實驗原理
提取的蛋白酶解之后，利用液質聯用技術對肽段進行質譜分析，通過比較不同樣品中相應肽段的信號強度，從而對肽段對應的蛋白質進行相對定量。每條肽段的豐度（量）與其在質譜中的峰面積或信號強度成正比；而不同樣品的同一條肽段在LC上的保留時間（retention time， RT）是一致的，因此，可以通過對比譜圖庫中的信息，再整合到相應蛋白，實現對蛋白質在不同樣本中的相對表達水平的定量分析[1, 2]。
技術優(yōu)勢
重現性好：采集所有離子及碎片譜圖，不丟失信息
選擇性好：基于碎片離子（即母子離子對）定量，與 SRM/MRM 相當
準確度高：循環(huán)時間固定，掃描點數均勻，定量準確度高
通量高：同時監(jiān)測所有目標蛋白/ 化合物，通量無上限
時效性強：對于易降解樣品可以即刻采集，獲得數據后再深入挖掘
數據易追溯：即使目前的水平無法發(fā)現某些蛋白/化合物，未來可以回溯
應用領域
臨床疾病標志物的篩選
作用機制研究
藥物作用靶點研究
疾病的分子分型等
