敏芯代謝組學(xué)平臺(tái)介紹
上海敏芯信息科技有限公司成立于2006年,是國內(nèi)第一家專業(yè)提供系統(tǒng)生物學(xué)技術(shù)服務(wù)的高科技公司。敏芯代謝組學(xué)平臺(tái)于2009年開始對外服務(wù),經(jīng)過近四年的發(fā)展,現(xiàn)平臺(tái)已擁有三大分析測試儀器(包括:GC/MS、LC/MS及NMR),實(shí)驗(yàn)室面積近400平米,服務(wù)內(nèi)容包括:樣本的制備、譜圖的采集、差異代謝物質(zhì)的挖掘與定性、以及多組學(xué)的整合分析等。敏芯代謝組學(xué)平臺(tái)服務(wù)的客戶已達(dá)百余家,合作發(fā)表SCI論文10余篇,并成功舉辦兩期
代謝組學(xué)培訓(xùn)班,共培訓(xùn)學(xué)員120余名。
GC-MS分析服務(wù)
氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(GC-MS)技術(shù),采用電子轟擊(EI)方式對代謝物組進(jìn)行分析。本實(shí)驗(yàn)平臺(tái)適宜于分析小分子、易揮發(fā)、熱穩(wěn)定、能氣化的化合物。我們能提供如下服務(wù):
實(shí)驗(yàn)內(nèi)容:
通過GC-MS分析技術(shù),分析處理組和正常組生物樣本的代謝組物,通過采集圖譜數(shù)據(jù),利用統(tǒng)計(jì)分析方法尋找組間中具有差異性的代謝產(chǎn)物,并對其定性。
實(shí)驗(yàn)階段:
☆預(yù)實(shí)驗(yàn)階段:對相關(guān)的實(shí)驗(yàn)條件(制備方法、儀器參數(shù)等)進(jìn)行摸索,優(yōu)化實(shí)驗(yàn)方法;
☆正式實(shí)驗(yàn)階段:對樣品進(jìn)行實(shí)驗(yàn)操作,得到質(zhì)譜圖;
數(shù)據(jù)分析階段:
對實(shí)驗(yàn)得出的原始數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,可以提供的分析包括:
² 數(shù)據(jù)預(yù)處理
² 差異分析
² 主成分分析(PCA)
² 偏最小二乘判別分析(PLS-DA)
² ROC診斷分析
² 預(yù)測模型構(gòu)建
² 多組學(xué)整合分析等
合作發(fā)表文章實(shí)例:
v 復(fù)旦大學(xué): Jiaoran Menga, Xiaodong Zhangb, Hao Wuc, Jing Bua, Chenyi Shia, Chunhui Denga,Yu Maob, Morphine-induced conditioned place preference in mice: Metabolomic profiling of brain tissue to find “molecular switch” of drug abuse by gas chromatography/mass spectrometry,Analytica Chimica Acta.2011.IF=4.31
v 中山醫(yī)院:Hao Wu, Ruyi Xue , Huazong Zeng, Xizhong Shen et al., Metabolomic profiling of human urine in hepatocellular carcinoma patients using gas chromatography/mass spectrometry, Analytica Chimica Acta,648 (2009) 98–104.IF=4.31
v 中山醫(yī)院:Wu H, Xue R, Tang Z, Deng C, Liu T, Zeng H, Sun Y, Shen X , Metabolomic investigation of gastric cancer tissue using gas chromatography/mass spectrometry , Anal Bioanal Chem. 2010;396(4):1385-95. IF=3.841
v 中山醫(yī)院:Wu H, Xue R, Tang Z, Deng C, Liu T, Zeng H, Sun Y, Shen X , GC/MS-based metabolomic approach to validate the role of urinary sarcosine and target biomarkers for human prostate cancer by microwave-assisted derivatization.IF=3.78
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bio-equip.com
上海敏芯信息科技有限公司
上海敏芯信息科技有限公司成立于2006年10月,是國內(nèi)知名的生物信息學(xué)服務(wù)提供商。隨著業(yè)務(wù)擴(kuò)展,公司已經(jīng)發(fā)展成為國內(nèi)第一家專業(yè)提供系統(tǒng)生物學(xué)服務(wù)的高科技企業(yè),提供包括基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)相關(guān)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、實(shí)驗(yàn)檢測、數(shù)據(jù)分析、結(jié)果驗(yàn)證及論文修改的全面解決方案。公司已獲得國家及上海市中小企業(yè)創(chuàng)新基金、上海市科技創(chuàng)新行動(dòng)計(jì)劃、上海市大學(xué)生創(chuàng)業(yè)基金、上海市專利試點(diǎn)企業(yè)、上海市技術(shù)成果轉(zhuǎn)化認(rèn)證、上海市楊浦區(qū)人才資助資金等多項(xiàng)國家及省部級(jí)獎(jiǎng)勵(lì)。
具體業(yè)務(wù)包括:
-基因芯片:表達(dá)譜芯片、miRNA芯片、SNP芯片、甲基化芯片、Exon芯片、Tilling芯片、lncRNA芯片等實(shí)驗(yàn)及數(shù)據(jù)分析
- 高通量測序:miRNA測序、mRNA測序、基因組重測序、甲基化測序、ChIP-Seq等實(shí)驗(yàn)及數(shù)據(jù)分析
-蛋白質(zhì)組學(xué):蛋白質(zhì)芯片(SELDI)、細(xì)胞因子芯片、ITRAQ、Shotgun Proteomics、DIGE-2D等
- 代謝組學(xué):液質(zhì)聯(lián)用(LC-MS)、氣質(zhì)聯(lián)用(GC-MS)及核磁共振(NMR)的實(shí)驗(yàn)及數(shù)據(jù)分析
- 文獻(xiàn)挖掘:提供基于pubmed數(shù)據(jù)庫的關(guān)鍵詞搜索服務(wù)
- 生物信息培訓(xùn):定期舉辦綜合性生物信息培訓(xùn)班,并提供上門培訓(xùn)服務(wù)及隨到隨學(xué)班
u 專利代理:提供生命科學(xué)領(lǐng)域的專利寫作、專利潤色及專利申請服務(wù)
- 實(shí)驗(yàn)服務(wù):引物設(shè)計(jì)、RT-PCR、3730測序、Western Blot、2D-MS等
目前,公司國內(nèi)外客戶已超過500家,合作發(fā)表了50多篇高影響因子的SCI(影響因子累計(jì)超過100分),并參與多項(xiàng)國家科研項(xiàng)目的申請與實(shí)施。