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RNA-SEQ分析
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RNA-SEQ 分析

        RNA-Seq就是指轉(zhuǎn)錄組的測序技術(shù),而RNA-Seq流程是指分析測序數(shù)據(jù)的一整套相關(guān)程序的集合,在這里面分享的內(nèi)容分別是:用soap軟件將測序后的數(shù)據(jù)比對到參考基因或參考基因組上、對比對后的數(shù)據(jù)進(jìn)行過濾、統(tǒng)計(jì)過濾后數(shù)據(jù)信息并計(jì)算基于的表達(dá)量,覆蓋率,長度等、查看reads在參考基因組上的分布情況、計(jì)算兩個樣本之間基因表達(dá)量的相關(guān)性、在兩個樣本之間篩選差異基因、對篩選出來的差異基因進(jìn)行聚類分析,對差異基因進(jìn)行GO功能富集分析、對差異基因進(jìn)行Pathway功能富集分析。
        該流程是針對深圳華因康基因科技有限公司自身的測序特點(diǎn)來編寫的,通過RNA-Seq流程的分析,可以了解某種樣本的基因表達(dá)情況,以及主要的生物學(xué)功能。

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