客戶提供研究方向關(guān)鍵詞(基因名稱,疾病名稱或其他信息),microSCI使用計算機文獻挖掘的方法挖掘文獻數(shù)據(jù)庫中對關(guān)鍵詞進行描述的信息。
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2013年9月28日上海豐核協(xié)助客戶拿到《journal of cellular and molecular medicine》雜志的最新接收函!
1、科研工作者申請科研基金的過程中缺少科研基礎(chǔ),或者是為研究方向沒有堅實的研究基礎(chǔ),是科研基金申請失敗的重要原因。
2、科研工作者第一次申請科研基金,將會在申請過程中遇到種種困惑和陷阱。怎樣選題,標題怎么寫,投放那些學科,創(chuàng)新性如何體現(xiàn),種種問題讓寫基金的科研工作者功敗垂成,只有寄希望于不斷的努力。
解決方案:
1、MicroSCI以客戶的研究方向為導向,綜合運用生物信息學技術(shù)方法預測可能結(jié)果。結(jié)果報告可放入基金申請的標書的立項依據(jù)部分,讓您的研究更加有理有據(jù)。
2、MicroSCI擁有強大的科研申請基金專家團隊,在自己的科研和學習工作中積累了豐富的經(jīng)驗和資料。歡迎您來信索取有關(guān)免費資料。
原理
客戶提供研究方向關(guān)鍵詞(基因名稱,疾病名稱或其他信息),microSCI使用計算機文獻挖掘的方法挖掘文獻數(shù)據(jù)庫中對關(guān)鍵詞進行描述的信息,然后對客戶自己擁有芯片或者是公共數(shù)據(jù)庫中已有芯片進行深入挖掘,進行后續(xù)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建,蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建,信號通路分析,基因功能富集分析,并且預測潛在和疾病有關(guān)的基因,從而后續(xù)研究提供了研究方向和指導建議。
意義
1、深入挖掘客戶的芯片結(jié)果,提升發(fā)表文章的檔次。
2、驗證芯片結(jié)果可靠性。
3、通過構(gòu)建基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),可以從轉(zhuǎn)錄調(diào)控角度揭示基因之間的相互作用。
4、進行信號通路有關(guān)的分析,可以尋找疾病的有關(guān)的重要信號通路。
5、總體了解把握研究方向并且尋找和現(xiàn)有研究方向有關(guān)的新的熱點和創(chuàng)新點,可以運用于基金申請的項目立項,研究背景以及科研論文綜述類寫作方面。
分析實例
文獻挖掘結(jié)合芯片挖掘預測潛在疾病有關(guān)基因
項目概述:
客戶提供關(guān)鍵詞“肺癌”和“甲基化”2組關(guān)鍵詞,我們幫助客戶找出已經(jīng)研究證實的肺癌甲基化有關(guān)的基因,并結(jié)合甲基化的芯片進行分析預測哪些基因可能通過甲基化的方式在肺癌的發(fā)生發(fā)展中起作用。
分析方法:
1、利用關(guān)鍵詞搜索文獻數(shù)據(jù)庫獲得所有肺癌甲基化相關(guān)的文獻。
2、利用計算機文獻挖掘的方法對文獻進行挖掘,找到相肺癌甲基化相關(guān)的所有基因/蛋白。
3、從公共數(shù)據(jù)庫中尋找芯片數(shù)據(jù)或者是客戶自行提供其芯片數(shù)據(jù)。
4、使用meta分析的方法整合芯片數(shù)據(jù),尋找芯片甲基化有關(guān)基因。
5、根據(jù)蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系構(gòu)建已有文獻挖掘基因集合和甲基化基因集合的關(guān)系。
6、通過整合文獻挖掘結(jié)果,轉(zhuǎn)錄調(diào)控數(shù)據(jù),蛋白-蛋白相互作用,基因融合等數(shù)據(jù),建立一個肺癌相關(guān)的小分子相互作用的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。
7、分析網(wǎng)絡(luò),得到潛在的可能和肺癌發(fā)生發(fā)展有關(guān)的基因。
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