非靶向代謝組學(xué)(即發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué))主要是將對照組和實(shí)驗(yàn)組的代謝組(某一生物體的全部代謝物)進(jìn)行比對,以找出其代謝物的差異。
|
||||||||||||||||||
[發(fā)表評論] [本類其他服務(wù)] [本類其他服務(wù)商] |
服務(wù)商: 上海中科新生命生物科技有限公司 | 查看該公司所有服務(wù) >> |
代謝組描述的是指生物體內(nèi)源性代謝物質(zhì)的整體,可以分為非靶向代謝組和靶向代謝組。非靶代謝組一般是基于LC-MS技術(shù)對樣本中的代謝物同時(shí)進(jìn)行定性和定量分析,與本地自建庫和商業(yè)標(biāo)準(zhǔn)品數(shù)據(jù)庫同時(shí)進(jìn)行一級、二級信息的匹配來進(jìn)行物質(zhì)鑒定。LC-MS方法適合檢測大部分代謝物,該技術(shù)成熟穩(wěn)定,是研究代謝變化的主流技術(shù),適用于各種復(fù)雜生物樣本,一次檢測能提供整體全面的代謝組信息。LC-MS比GC-MS的適用范圍更廣,適合各種復(fù)雜生物樣本。
樣本類型 | 常規(guī)送樣量 | 最低送樣量 | 建議生物學(xué)重復(fù) |
血(血清、血漿) | ≥200 μL | ≥100 μL | 臨床樣本:每組≥ 30 例 動物來源:每組≥ 10 例 植物來源:每組≥ 3 例 細(xì)胞樣本:每組≥ 6 例 |
尿液 | ≥200 μL | ≥100 μL | |
動物組織 | ≥100 mg | ≥60 mg | |
細(xì)胞 | 10^7 | 10^7 | |
細(xì)胞上清 | ≥1mL | ≥500 μL | |
細(xì)菌或真菌 | 沉淀濕重≥200 mg | 沉淀濕重≥100 mg | |
發(fā)酵液 | ≥500 μL | ≥200 μL | |
其他液體樣本: 卵泡液、腦脊液、淋巴液等 |
≥200 μL | ≥100 μL | |
植物組織 | ≥400 mg | ≥200 mg | |
植物種子 | ≥200 mg | ≥100 mg | |
其他特殊樣本 | 請聯(lián)系我們咨詢 |
分析類型 | 分析內(nèi)容 |
質(zhì)控 | TIC、QC等多項(xiàng) |
輪廓分析 | Superclass分類 |
差異分析 | 單變量統(tǒng)計(jì)分析(火山圖等) |
多維統(tǒng)計(jì)分析(PCA、PLSDA、OPLSDA)等 | |
功能分析 | 層次聚類分析 |
相關(guān)性分析 | |
KEGG分析 | |
高級生信分析 | WGCNA分析 |
回歸分析 | |
趨勢聚類分析 | |
機(jī)器學(xué)習(xí) |
代謝物類型(HMDB class分類) | 鑒定數(shù)目 | 鑒定結(jié)果中代表性物質(zhì) |
羧酸及其衍生物 | 200+ | 谷氨酸、天冬酰胺、肌酸、琥珀酸、酪氨酸… |
脂類似物 | 300+ | 2-亞油酸甘油、3-羥油酸肉堿… |
有機(jī)雜環(huán)化合物 | 100+ | 鳥嘌呤、色氨酸、煙酰胺、尿膽素… |
苯環(huán)型化合物 | 100+ | 水楊酸、馬尿酸… |
有機(jī)氧化合物 | 80+ | 乳糖、犬尿氨酸、2’-脫氧-核糖… |
有機(jī)氮化合物 | 30+ | 乙酰膽堿、鞘氨醇、三甲胺氮氧化物、胍基丙酸… |
核苷酸類似物 | 20+ | ADP、S-甲基-5'-硫代腺苷 |
其他 | 200+ | |
備注:不同項(xiàng)目和樣本類型鑒定數(shù)目和種類會有所區(qū)別,如需獲取其他信息請聯(lián)系我們索取 |
1.Intranasal Exposure to ZnO Nanoparticles Induces Alterations in Cholinergic Neurotransmission in Rat Brain. Nano Today. 2020.
非靶代謝-大鼠腦組織- ZnO暴露的毒性影響【客戶文獻(xiàn)】
2.One-carbon metabolism supports S-Adenosylmethionine and histone methylation to drive inflammatory macrophages. Mol Cell. 2019.
非靶代謝-小鼠細(xì)胞-一碳代謝通過甲基化來調(diào)節(jié)炎癥【客戶文獻(xiàn)】
3.Hexosamine biosynthetic pathway promotes the antiviral activity of SAMHD1 by enhancing O-GlcNAc transferase-mediated protein O-GlcNAcylation. Theranostics. 2020.
非靶代謝-人細(xì)胞-增強(qiáng)O-GlcNAc轉(zhuǎn)移酶可促進(jìn)SAMHD1的抗病毒活性【客戶文獻(xiàn)】