靶向代謝組學(xué)分析主要是以標(biāo)準(zhǔn)品為參照,對(duì)特定的代謝物群進(jìn)行有針對(duì)性地、特異性地檢測與分析。
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產(chǎn)品定義
靶向代謝組學(xué)分析主要是以標(biāo)準(zhǔn)品為參照,對(duì)特定的代謝物群進(jìn)行有針對(duì)性地、特異性地檢測與分析。通常采用的技術(shù)方案包括常規(guī)的液質(zhì)聯(lián)用(LC-MS)分析技術(shù),以及選擇性反應(yīng)/多反應(yīng)監(jiān)測技術(shù)(MRM/ SRM)。
技術(shù)原理
常規(guī)分析法首先利用LC-MS的方法對(duì)待分析樣本進(jìn)行大規(guī)模代謝組分析,然后通過與相同分析條件下標(biāo)準(zhǔn)品的分析結(jié)果進(jìn)行比對(duì),實(shí)現(xiàn)對(duì)樣本內(nèi)目標(biāo)代謝群的定性和定量分析。
MRM/SRM技術(shù)是更為特異、靈敏的靶向分析方法。其主要基于已知或假定的反應(yīng)離子信息,有針對(duì)性地選擇數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)譜信號(hào)采集,對(duì)符合規(guī)則的離子對(duì)進(jìn)行信號(hào)記錄,去除不符合規(guī)則離子信號(hào)的干擾。定量過程中,該技術(shù)首先篩選到目標(biāo)代謝物特異性的母離子,然后選擇性地對(duì)這些母離子進(jìn)行碰撞誘導(dǎo),去除其他離子的干擾,只對(duì)選定的特異MS/MS2離子進(jìn)行質(zhì)譜信號(hào)的采集,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)代謝分子更為特異、靈敏、準(zhǔn)確的分析。
代謝物 分子離子 LC/ESI MS CID selection Transition
實(shí)驗(yàn)流程(MRM)
使用儀器
常規(guī)分析法:AB SCIEX Triple TOFTM 5600
MRM/SRM:AB SCIEX Triple Quad™ 5500
液相色譜柱
C18反相柱、HILIC親水柱
技術(shù)優(yōu)勢
常規(guī)分析法:高通量分析能力,相比于MRM/SRM簡便、經(jīng)濟(jì)
MRM/SRM:高通量分析能力,兼具高選擇性、高特異性、高準(zhǔn)確度、高重現(xiàn)性、高靈敏度、寬動(dòng)態(tài)范圍
應(yīng)用領(lǐng)域
∴ 非靶向代謝物組學(xué)結(jié)果的驗(yàn)證
∴ 代謝相關(guān)生理、病理研究
∴ 發(fā)酵工藝研究
∴ 食品科學(xué)與營養(yǎng)學(xué)研究
技術(shù)參考案例
[1] Wei R, Li G, et al. High-throughput and multiplexed LC/MS/MRM method for targeted Metabolomics. Anal Chem. 2010; 82(13):5527-33.
[2] Roberts LD, Souza AL, et al. Targeted metabolomics. Curr Protoc Mol Biol. 2012; Chapter 30:Unit 30.2.1-24.