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表達(dá)譜芯片 芯片技術(shù)服務(wù)
芯片平臺(tái)有安捷倫DNA微陣列掃描儀、Affymetrix新型基因芯片掃描儀。實(shí)驗(yàn)報(bào)告涵蓋芯片的原始數(shù)據(jù)和芯片圖像,并以文本形式提供給您所有樣品的基因分型和置信度評(píng)分等。
服務(wù)類別:其他生物研發(fā)總訪問(wèn):1098
最后更新:2022-8-30半年訪問(wèn):33
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芯片技術(shù)服務(wù)
 
表達(dá)譜芯片
 
表達(dá)譜芯片是采用cDNA或寡核苷酸片段作探針,固化在芯片上,將待測(cè)樣品(處理組)與對(duì)照樣品的mRNA以兩種不同的熒光分子進(jìn)行標(biāo)記,然后同時(shí)與芯片進(jìn)行雜交,通過(guò)分析兩種樣品與探針雜交的熒光強(qiáng)度的比值,來(lái)檢測(cè)基因表達(dá)水平的變化。
 
1. 應(yīng)用領(lǐng)域
Ø 疾病研究: 研究疾病的基因表達(dá)時(shí)空特征,揭示疾病的分子基礎(chǔ); 研究疾病的基因表達(dá)差異,尋找疾病分型的分子指標(biāo);研究疾病治療前后的基因表達(dá)差異,從基因組學(xué)上評(píng)估其時(shí)效性。
Ø 臨床診斷: 可用于某些疾病的臨床診斷。
Ø 藥物篩選: 藥物藥理機(jī)制分析,藥物的毒性毒理研究。
 
2. 我們提供的全基因組表達(dá)譜芯片檢測(cè)服務(wù)
客戶根據(jù)需要,可以選擇不同廠家的全基因組表達(dá)譜芯片,包括Agilent、Affymetrix平臺(tái),可為您提供全基因組表達(dá)譜芯片分析以及后續(xù)的生物信息學(xué)檢測(cè)分析服務(wù)。
 
(1)Agilent全基因組表達(dá)譜芯片
安捷倫高性能的表達(dá)譜芯片為客戶的基因表達(dá)研究提供了靈活以及高性價(jià)比的研究平臺(tái),產(chǎn)品芯片覆蓋了30多種不同物種,配備以高品質(zhì)的60-mer寡核苷酸針,設(shè)計(jì)出以4× 44K規(guī)格為主的表達(dá)譜芯片。此外客戶可以根據(jù)自己的需要在安捷倫的eArray在線服務(wù)平臺(tái)設(shè)計(jì)任何需要的芯片,不受目錄芯片限制。
 
技術(shù)特點(diǎn)
Ø 獨(dú)特的SurePrint原位合成技術(shù):SurePrint技術(shù)依靠強(qiáng)大的探針設(shè)計(jì)運(yùn)算法則和準(zhǔn)確的確認(rèn)方法,無(wú)需“光掩膜”,并利用工業(yè)規(guī)模的噴墨打印技術(shù)和獨(dú)特的質(zhì)控程序來(lái)合成芯片。
Ø 雙色芯片檢測(cè):可以根據(jù)客戶的需要,將相互比較的兩個(gè)樣本分別用不同的熒光標(biāo)記,雜交在同一張芯片上。相較于到傳統(tǒng)的單色芯片檢測(cè),此方法可以發(fā)現(xiàn)更微小的表達(dá)差異,并有效地控制實(shí)驗(yàn)的批次差異。
Ø 用量少:只需200ng 總RNA 即可用來(lái)進(jìn)行標(biāo)記實(shí)驗(yàn)(不包括質(zhì)檢所消耗的量),大大降低了RNA抽提的難度,能讓客戶利用剩下的總RNA進(jìn)行驗(yàn)證。
Ø 靈活方便的定制服務(wù):安捷倫公司除了提供成品芯片外,還開(kāi)放了一個(gè)免費(fèi)的eArray芯片設(shè)計(jì)平臺(tái),讓客戶可以根據(jù)自己的需求設(shè)計(jì)專有的芯片,同時(shí)亦可讓客戶分享其他客戶的定制芯片,滿足客戶不同的研究需要。
 
檢測(cè)原理
 用兩種不同的熒光分別標(biāo)記實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組擴(kuò)增后的cRNA,調(diào)整好兩組的雜交用量,然后與表達(dá)譜芯片雜交,通過(guò)掃描芯片上兩種熒光(紅、綠)的相對(duì)強(qiáng)度比率,兩組RNA有差異的部分會(huì)出現(xiàn)顏色偏移,從而計(jì)算出相應(yīng)基因表達(dá)量是上調(diào)還是下調(diào)。如果選擇做單色熒光標(biāo)記的表達(dá)譜芯片檢測(cè),只需用一種熒光標(biāo)記一個(gè)樣本進(jìn)行雜交即可。
 
(2)Agilent 比較基因組雜交(CGH)芯片服務(wù)
  CGH芯片(aCGH)是2005年安捷倫推出一種突破性的生物芯片平臺(tái),這種平臺(tái)能夠支持研究人員精確掃描所研究物種的全基因組染色體的微小變化。安捷倫提供多種規(guī)格的CGH芯片,除了人類CGH芯片,還提供其他多種物種的CGH芯片,如小鼠、大鼠及各種模式生物等。
 
技術(shù)特點(diǎn)
Ø 開(kāi)放式的系統(tǒng)設(shè)計(jì):安捷倫執(zhí)行的是全球統(tǒng)一的芯片標(biāo)準(zhǔn),既可以為客戶提供全套解決方案,又可與其它技術(shù)平臺(tái)或客戶的自有技術(shù)銜接,為客戶提供最大的自由空間。
Ø 獨(dú)特的制作技術(shù): 無(wú)需“光掩膜”的噴墨化學(xué)原位合成專利技術(shù)提供了芯片制作極大的穩(wěn)定性和靈活性,安捷倫提供高質(zhì)量的各種密度和規(guī)格的芯片(1×244K, 1×1M, 4×44K, 2×105K, 8×15K, 2×400K ,4×180K, 8×60K等),滿足客戶的各種需求。
Ø 靈敏的檢測(cè)能力: 60mer的探針設(shè)計(jì)賦予安捷倫芯片極佳的檢測(cè)性能,這對(duì)低豐度基因的檢測(cè)顯得尤為重要。在美國(guó)FDA組織的全球基因芯片質(zhì)量評(píng)估計(jì)劃(MAQC)中,在所有參與評(píng)估的當(dāng)今基因芯片主流產(chǎn)品中,安捷倫基因芯片能檢測(cè)出最多的基因數(shù)。
Ø 方便的定制服務(wù):安捷倫推出唯一的免費(fèi)芯片探針設(shè)計(jì)工具----eArray。科研客戶只需簡(jiǎn)單登錄即可訪問(wèn)安捷倫公司的各種物種、不同應(yīng)用類型的基因芯片探針數(shù)據(jù)庫(kù),在其中選擇符合自己要求的探針設(shè)計(jì)芯片?蛻粢部梢陨陷d自己專有的基因序列信息來(lái)設(shè)計(jì)芯片,安捷倫可根據(jù)提交的設(shè)計(jì)方案量身定制獨(dú)有的芯片產(chǎn)品。
 
檢測(cè)原理
    aCGH的基本原理是用不同的熒光染料(常用Cyanine 3-dUTP和Cyanine 5-dUTP)分別標(biāo)記對(duì)照樣本基因組DNA與實(shí)驗(yàn)樣本基因組DNA,然后與制備好的aCGH微陣列芯片進(jìn)行雜交,通過(guò)掃描芯片檢測(cè)染色體上兩種熒光(紅、綠)的相對(duì)強(qiáng)度比率,可以計(jì)算出DNA的缺失與擴(kuò)增,從而了解實(shí)驗(yàn)樣本基因組DNA拷貝數(shù)的改變情況,并能同時(shí)在染色體上進(jìn)行精確定位。aCGH技術(shù)能在一次實(shí)驗(yàn)中實(shí)現(xiàn)全基因組掃描,檢測(cè)出所有染色體的不平衡變化,并且具有較高的分辨率。見(jiàn)圖17。
 
 
圖17. aCGH的檢測(cè)原理
 
 
其它芯片技術(shù)服務(wù):
 
* ChIP-on-chip芯片
* DNA甲基化芯片
* 微小RNA(miRNA)芯片
 
"實(shí)驗(yàn)報(bào)告內(nèi)容簡(jiǎn)介"
 
“芯片技術(shù)服務(wù)平臺(tái)介紹”
 

上海鈺森生物技術(shù)有限公司成立10多年,專注科研服務(wù),建立了自己的實(shí)驗(yàn)技術(shù)平臺(tái),能夠提供動(dòng)物造模、細(xì)胞培養(yǎng)、細(xì)胞實(shí)驗(yàn)(細(xì)胞染色、侵襲、趨化、轉(zhuǎn)移、增殖、活性、凋亡等)、免疫印跡(WB)、PCR和Q-PCR、免疫組化(IHC-P/F)、免疫共沉淀(Co-IP)、質(zhì)粒構(gòu)建、病毒包裝、RNA干擾……多項(xiàng)單項(xiàng)實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)和課題總包服務(wù),是國(guó)內(nèi)自建較全面基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)平臺(tái)、最早從事生物技術(shù)服務(wù)為數(shù)不多的公司之一。

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