外泌體全轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)

       外泌體中攜帶有來自母本細胞的多種蛋白質(zhì)、脂類、RNA等重要信息。對外泌體中的長鏈RNAs進行全轉(zhuǎn)錄組測序分析，一次測序?qū)嶒�，即可以獲得上萬條長鏈RNAs的檢測數(shù)據(jù)，全面覆蓋 mRNA、lncRNA和 circRNA等長鏈RNAs。外泌體全轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)量大、信息全面，是發(fā)現(xiàn)特異性疾病診斷標志物、進行多組學(xué)分析的重要手段。同時，由于外泌體攜帶的長鏈RNAs中有超過70%為mRNA，外泌體全轉(zhuǎn)錄組測序的結(jié)果不僅可以進行深入的基因功能注釋，而且還能夠分析到外泌體可能來源的細胞類型及占比（即外泌體溯源）。

 

 

 

|   華盈生物全轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)

       華盈生物外泌體全轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)體系，充分結(jié)合了專利微量核酸建庫技術(shù)、NGS技術(shù)和全新的生物信息序列比對算法，可對血漿中外泌體的mRNA、lncRNA和circRNA 等RNAs進行充分捕獲和測序，可以實現(xiàn)從1mL血漿分離的外泌體中，穩(wěn)定檢出超過1萬條長鏈RNAs。

|   分析內(nèi)容

|   經(jīng)典案例：血漿外泌體全轉(zhuǎn)錄組篩選胰腺癌標志物發(fā)現(xiàn)

       2020年，復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院研究團隊從1mL血漿中分離外泌體，利用專利建庫技術(shù)進行全轉(zhuǎn)錄組測序，成功篩選到了8種長鏈RNA，其形成的胰腺癌診斷標志物組合，比傳統(tǒng)的CA19-9更加靈敏和特異。

       外泌體全轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果顯示：入組人群血漿外泌體中的mRNA普遍富集度最高，其次是LncRNA。隨機森林等數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn)8種長鏈RNA在PDAC患者中普遍高于CP和HC組，可作為潛在診斷標志物。由8種長鏈RNA組成的標志物組合d-signature對于Ⅰ和Ⅱ期胰腺導(dǎo)管腺癌的診斷效能AUC 達到0.949， 遠高于經(jīng)典標志物CA19 -9 。聯(lián)合d-signature和CA19-9診斷時，診斷效能進一步提高到AUC=0.964。

|   華盈優(yōu)勢

1. 一站式服務(wù)體系：

客戶只需提供血漿樣本，華盈生物為您完成從樣品準備，文庫制備，上機測序到數(shù)據(jù)分析整套服務(wù)流程。

2.專利建庫技術(shù)：

華盈生物采用的專利微量核酸建庫技術(shù)，可對僅1mL血漿中提取的外泌體RNA進行建庫和測序分析。

3.專業(yè)生物信息分析：

華盈生物具有強大的生物信息學(xué)團隊，能夠滿足客戶的各類深入數(shù)據(jù)分析要求，相關(guān)分析示例如下：

|   相關(guān)文獻

[1]. Xihao Du, Qingli Zhang, Yixuan Jiang, et al. Dynamic molecular choreography induced by traffic exposure: A randomized, crossover trial using multi-omics profiling. J Hazard Mater. 2022 Feb 15;424(Pt A):127359. IF=10.588

[2]. Jin Ji, Rui Chen, Lin Zhao, et al. Circulating exosomal mRNA profiling identifies novel signatures for the detection of prostate cancer. Mol Cancer. 2021 Mar 30;20(1):58. IF=27.401

[3]. Chu-Wen Chen, Min Fu, Zhi-Hao Du, et al. Long Noncoding RNA MRPL23-AS1 Promoteoid Cystic Carcinoma Lung Metastasis. Cancer Res. 2020 Jun 1;80(11):2273-2285. IF=12.479

[4]. Shulin Yu, Yuchen Li, Zhuan Liao, et al. Plasma extracellular vesicle long RNA profiling identifies a diagnostic signature for the detection of pancreatic ductal adenocarcinoma]. Gut, 2019, 69(3):gutjnl-2019-318860. IF=23.059

[5]. Yuchen Li, Jingjing Zhao, Shulin Yu, et al. Extracellular Vesicles Long RNA Sequencing Reveals Abundant mRNA, circRNA, and lncRNA in Human Blood as Potential Biomarkers for Cancer Diagnosis. Clin Chem. 2019 Jun;65(6):798-808. IF=8.327