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CUT&Tag技術(shù)服務(wù)
CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是研究DNA與蛋白互作的新技術(shù)。
服務(wù)類(lèi)別:其他生物研發(fā)總訪問(wèn):201
最后更新:2024-8-6半年訪問(wèn):18
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CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是研究DNA與蛋白互作的新技術(shù)。與ChIP-Seq相比,CUT&Tag不需要甲醛交聯(lián)和免疫共沉淀的過(guò)程,而是通過(guò)靶蛋白的抗體和Protein A的介導(dǎo),使Protein A融合的Tn5轉(zhuǎn)座酶靶向并切割DNA,同時(shí)在序列兩端加上測(cè)序接頭,經(jīng)PCR擴(kuò)增后形成高通量測(cè)序文庫(kù)。

優(yōu)點(diǎn):

靈敏度高;重復(fù)性好

實(shí)驗(yàn)流程圖:

細(xì)胞與ConA beads結(jié)合——細(xì)胞滲透性處理——一抗與目的蛋白特異性結(jié)合——二抗結(jié)合一抗放大信號(hào)——加入pA-Tn5與抗體結(jié)合——通過(guò)Mg2+激活轉(zhuǎn)座體,片段化目的蛋白結(jié)合的DNA,并加上接頭序列——DNA提取與擴(kuò)增-高通量測(cè)序
 
客戶提供材料 交付結(jié)果

凍存細(xì)胞:細(xì)胞數(shù)>10萬(wàn)

凍存組織:組織量>40 mg

一抗(請(qǐng)使用ChIP級(jí)別的一抗,提供未稀釋的抗體原液,

送樣前請(qǐng)將抗體的說(shuō)明書(shū)發(fā)給我們,以便安排后續(xù)實(shí)驗(yàn))

實(shí)驗(yàn)過(guò)程圖

高通量測(cè)序原始數(shù)據(jù)

生物信息學(xué)分析結(jié)果



CUT&Tag數(shù)據(jù):
使用CUT&Tag,鑒定H3K27me3在染色質(zhì)水平上的peaks。與ChIP-seq相比,在相同Reads條件下,兩者的Peaks一致,并且CUT&Tag的信噪比更高、背景更低。
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