宿主細胞DNA殘留量和殘留片段大小檢測的重要性和方法
宿主細胞DNA殘留量和殘留片段大小質(zhì)控解決方案
許多生物制品如基因治療產(chǎn)品、疫苗、重組抗體藥等均需用到動物細胞、細菌或酵母作為宿主細胞進行生產(chǎn)。然而，宿主細胞DNA的殘留，具有潛在的致瘤性和/或傳染性風險，因此，需嚴格的控制生物制品中宿主細胞DNA的殘留。
我國藥典以及美國FDA均對宿主殘留DNA量進行明文規(guī)范：例如2020版《中國藥典》明確規(guī)定用Vero細胞生產(chǎn)人用狂犬病疫苗，Vero細胞DNA殘留應不高于3ng/劑；FDA在《Characterization and Qualification of Cell Substrates and Other Biological Materials Used in the Production of Viral Vaccines for Infectious Disease Indications》的行業(yè)指南中要求對殘留的DNA進行檢測。
由于法規(guī)的嚴格規(guī)范，我國藥典（2020年版）三部通則推薦了三種方法檢測宿主細胞殘留 DNA 含量，包括DNA探針雜交法、熒光染色法和定量PCR法，目前行業(yè)內(nèi)對宿主細胞DNA含量殘留檢測已達成共識。
01 宿主細胞DNA殘留片段大小檢測的重要性
隨著技術(shù)的發(fā)展，人們認識到，除了要減少殘留DNA的量，也應該降低宿主DNA片段的大小至功能基因大�。ɑ谀壳暗淖C據(jù)，大約200bp）以下，從而減少致瘤性和感染性風險。
基于此，CDE 2022年5月發(fā)布的《體內(nèi)基因治療產(chǎn)品藥學研究與評價技術(shù) 指導原則（試行）》中明確指出，生產(chǎn)若使用了腫瘤細胞系（如 Hela 細胞）、致瘤細胞系，或攜帶有致瘤基因、病毒來源序列的細胞（如 HEK 293T 細胞），在確保無完整活細胞殘留的同時，需對DNA的殘留量和殘留片段大小進行控制，合理擬定標準限度。如有可能，建議盡量將殘留DNA控制在10ng/劑以內(nèi)， DNA殘留片段的大小控制在200bp以下。
對于產(chǎn)品中已知的、具有潛在安全性風險的特定轉(zhuǎn)化序列，如 HEK 293T 細胞攜帶的 Adv E1A 序 列、SV40 大 T 抗原序列，Hela 細胞攜帶的 HPV（Human Papilloma virus）E6/E7 基因等，應分別進行殘留控制。對于 AAV 等易于將非載體DNA包裝入病毒顆粒的病毒載體，在選擇包裝細胞、輔助病毒和包裝質(zhì)粒時應考慮相關(guān)外源 DNA 包裝入病毒顆粒的潛在風險。
02 用什么方法檢測宿主DNA殘留片段大�。�
相比于多種方式用于DNA宿主殘留量的檢測，用哪種方法來檢測宿主DNA殘留片段大小，中國藥典并沒有明確規(guī)定。
但是對于核酸片段大小的檢測，這并不是一個新概念，在日常的分子實驗中，對核酸片段大小的界定可通過核酸電泳初步評估。
然而，更高效和便捷的核酸片段大小分析設(shè)備例如LabChip GX Touch核酸分析儀早已在NGS領(lǐng)域大展宏圖，生物制藥宿主DNA殘留片段大小檢測更是小試牛刀。
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