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圖書
637 次
ChIP-seq等揭示熱休克轉錄因子A1b調控植物高溫脅迫響應的分子機制
2023-4-24
在擬南芥中,熱休克轉錄因子A1b(HEAT SHOCK TRANSCRIPTION FACTORA1b,HSFA1b)通過影響種子產(chǎn)量來調控對環(huán)境脅迫的抗性。HSFA1b是生殖適應性的決定性因素,這種調控機制怎么形成的呢?2018年,
742 次
全基因組CpG密度和DNA甲基化分析方法MeDIP、RRBS和WGBS的比較
2023-4-17
CpG密度(CpG density)與各種組織中的DNA甲基化相關;蚪M按CpG密度分為:CpG島(CpG island,CGI)、CpG島上下游2kb以內的區(qū)域(CpG shore ,CpG島岸)、CpG島岸上下游2kb以內的區(qū)域(CpG s
597 次
RNA m6A甲基化修飾在馬鈴薯/水稻/玉米/小麥等不同農作物中的研究進展
2023-3-30
m6A是RNA上最豐富的一種修飾,平均每條轉錄本有1~3個m6A修飾。植物也有相應的m6A writers、readers、erasers系統(tǒng)。本期我們通過3篇RNA m6A甲基化修飾在農作物物中的研究成果來聚焦RNA甲基化在植
916 次
抗體基礎知識介紹
2023-3-30
抗體(antibody,Ab)是機體在體內存在的外來分子、微生物等抗原物質刺激下,由B淋巴細胞或記憶細胞增殖分化成的漿細胞所產(chǎn)生的、可與相應抗原發(fā)生特異性結合的免疫球蛋白(immunoglobulins,Ig
496 次
m6A mRNA甲基化修飾調控CTNNB1促進肝母細胞瘤增殖的機制研究
2023-3-29
2019年12月23日,國家兒童醫(yī)學中心(上海)、上海交通大學醫(yī)學院附屬上海兒童醫(yī)學中心潘秋輝教授團隊在《Molecular Cancer》(IF:41.444/Q1)雜志上發(fā)表了題為“m6A mRNA methylation regu
632 次
高通量測序后的下游實驗驗證方法之ChIP-seq介紹
2023-3-28
此前,我們分享了染色質免疫共沉淀測序(ChIP-seq)的數(shù)據(jù)挖掘思路,進而篩選出TF結合/組蛋白修飾的目標區(qū)域和候選靶基因。做完ChIP-seq測序后,如果需要對分析結果中感興趣的內容進行后期驗證,
971 次
染色質免疫共沉淀測序(ChIP-seq)的數(shù)據(jù)挖掘思路
2023-3-27
CHIP-seq研究的數(shù)據(jù)挖掘思路主要分為3步:1. 整體把握CHIP-seq圖譜特征:peak/reads在基因組上的分布、peak在元件上的富集、peak在基因元件上的分布、peak的motif分析、peak距離TSS位點的距離分
743 次
ChIP-seq(組蛋白)揭示H3K36me修飾影響溫度誘導的植物可變剪接和開花
2023-2-22
2017年,荷蘭瓦格寧根大學分子實驗室RGH Immink團隊以“Histone H3 lysine 36 methylation affects temperature-induced alternative splicing and flowering in plants”在《Genome
2685
次
定量分析ChIP-qPCR數(shù)據(jù)的方法:Percent Input法和富集倍數(shù)法步驟介紹
2023-2-22
ChIP-qPCR 數(shù)據(jù)需要針對可變性來源進行標準化,包括染色質數(shù)量、免疫沉淀的效率(富集效率)和 DNA 回收率。兩種常用的標準化 ChIP-qPCR 數(shù)據(jù)方法——Percent Input法和富集倍數(shù)法(F
729 次
染色質免疫共沉淀ChIP實驗的詳細實驗步驟
2023-2-10
染色質免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP),是研究體內蛋白質與DNA相互作用的經(jīng)典方法。開始 ChIP 之前要考慮三件事(1)為您的實驗查找適合的抗體(2)優(yōu)化染色質剪切(3)評估您
894 次
大腸桿菌中的蛋白在IPTG誘導下的表達操作步驟
2023-2-3
蛋白的重組表達是指將外源基因克隆在含有特定啟動子的表達載體中,讓其在大腸桿菌中在IPTG的誘導下過量表達。蛋白質純化的第一步是在細胞宿主中表達蛋白質。制備的pET28-His6-GFP含有iptg誘導的
5605
次
免疫共沉淀Co-IP實驗流程及文獻中的結果解讀
2023-1-4
What is Co-IP?Co-IP全稱Co-Immunoprecipitation,中文學名免疫共沉淀,是一種以抗體和抗原識別專一性為基礎,用于研究蛋白質之間相互作用的經(jīng)典方法。通俗點來說,假設我們需要研究樣品中A蛋白
718 次
ZIP1缺陷型小鼠在揭秘肺癌的化療耐藥性研究中的應用
2022-12-8
肺癌是造成全球癌癥死亡的主要原因。化學療法、放射療法、靶向生物療法以及近年來的免疫療法是肺癌患者的主要治療選擇,但腫瘤與基質成纖維細胞間的某些相互作用會引起肺癌的化療耐藥性,導致癌
1887
次
ABI-PCR儀使用方法及維修服務操作使用步驟
2022-4-22
ABI-PCR儀 - 技術原理;ABIPCR儀售后維修熱線:400-8090039;DNA的半保留復制是生物進化和傳代的重要途徑。雙鏈DNA在多種酶的作用下可以變性解鏈成單鏈,在DNA聚合酶與啟動子的參與下,根據(jù)堿基互
1457
次
新冠研究前沿:在iPS中利用CRISPRi系統(tǒng)發(fā)現(xiàn)病毒感染新機制(NEPA21)
2022-3-8
新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)是一種嚴重的急性呼吸道傳染性疾病,其由急性呼吸綜合征冠狀病毒SARS-CoV-2感染所致。自COVID-19新冠肺炎疫情爆發(fā)至今,已兩年有余。除了疫苗接種,目前醫(yī)學界還沒有
2294
次
ChipCytometry在深度挖掘FFPE石蠟組織切片空間蛋白組學信息的應用
2022-1-4
組織微環(huán)境的深度剖析對于理解疾病生物學機制及進展至關重要。在前面一期分享中,ChipCytometry技術的生物標志物空間剖析與數(shù)據(jù)分析能力完美結合讓大家印象深刻(Chipcytometry:讓生物標志物分
1575
次
MeRIP-Seq & RIP-Seq在肺動脈高壓m6A蛋白YTHDF1機制研究的應用
2021-11-22
N6-甲基腺苷(m6A)是最普遍的mRNA內部修飾,通過甲基化酶(writer)、去甲基化化酶(eraser)和閱讀蛋白(reader)的合作參與細胞過程。m6A對mRNA下游調控如翻譯、輸出和穩(wěn)定性的影響主要由識別
4119
次
目前已上市的三款多柔比星脂質體的對比及市場情況分析
2021-10-18
本期AVT小編為大家系統(tǒng)聊一聊鹽酸多柔比星脂質體產(chǎn)品,早在上世紀90年代鹽酸多柔比星脂質體就已經(jīng)上市了,目前國外共有三款產(chǎn)品,那么它們有什么區(qū)別?目前國內外市場情況又如何呢?下面小編大家
17671
次
MeRIP-qPCR方法原理、結果含義、展示方法及應用細談
2021-8-10
m6A等RNA修飾的主要研究手段是通過MeRIP方法對發(fā)生修飾的片段進行富集,其后進行高通量測序分析修飾位點。而無論是一篇僅展示修飾位點分布特點的譜學文章,還是深入研究修飾調控基因表達機制的文
1687
次
Hippo 途徑與靶向策略
2021-8-3
在 PubMed 輸入了“Hippo pathway or YAP/TAZ”,小編發(fā)現(xiàn)近十年來與 Hippo 通路沾點邊的研究勢頭猛烈,且發(fā)的文章不少都“非富即貴”,如發(fā)表在 Nature Cell Biology 上的兩篇關于 YAP (TAZ) 相
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