數(shù)字表達(dá)譜分析;DGE測序;表達(dá)譜分析
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技術(shù)簡介
數(shù)字基因表達(dá)譜(DGE)是研究某一物種特定組織在特定狀態(tài)下的基因表達(dá)情況,能夠全面、經(jīng)濟(jì)、快速地檢測不同材料間的差異表達(dá)基因。
技術(shù)路線圖
生物信息分析
常規(guī)分析:
1.測序數(shù)據(jù)質(zhì)控分析
2.庫容量飽和度分析
3.高質(zhì)量序列與參考基因組比對
4.全基因組序列(reads)分布圖譜
5.基因表達(dá)量統(tǒng)計(jì)分析
6.樣品可重復(fù)性分析
高級分析:
7.樣本間差異表達(dá)基因分析
8.差異表達(dá)基因GO功能富集分析
9.差異表達(dá)基因KEGG富集分析
10.蛋白網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及分析
個(gè)性化分析:
11.根據(jù)客戶需求進(jìn)行個(gè)性化定制分析
案例解析
基因表達(dá)分析
基因表達(dá)量的非監(jiān)督層次聚類分析表明CHB病人和HBC病人群體之間的基因表達(dá)量具有顯著性差異。
測序策略及數(shù)據(jù)量
測序策略:SE50
建議數(shù)據(jù)量:一般測序:10M clean reads
深度測序:20M clean reads