tRF&tiRNA測序

  tRF&tiRNA 測序

    tRFs和tiRNAs 是tRNA及其前體通過精確調(diào)控的加工過程產(chǎn)生的，作為小非編碼RNA行使多種生理功能，與諸多生理病理過程相關(guān)（圖1）。據(jù)報道，tRFs&tiRNAs能夠以microRNA的方式參與RNA干擾；結(jié)合蛋白因子并調(diào)節(jié)目標(biāo)mRNA的穩(wěn)定性；與細(xì)胞色素C互作，調(diào)控細(xì)胞凋亡；改變胚胎轉(zhuǎn)錄級聯(lián)調(diào)控，作為父本表觀遺傳因子介導(dǎo)代謝疾病遺傳；多種應(yīng)激條件下促進(jìn)應(yīng)激顆粒的組裝。
    tRFs&tiRNAs 的組成和數(shù)量高度依賴于具體的細(xì)胞類型和病理狀況，使得它們成為一類極佳的生物標(biāo)志物[1]。例如，tRFs&tiRNAs 之間的比例關(guān)系能夠作為癌癥存活期指標(biāo)和潛在的診斷標(biāo)志物[2]。同時，相比其他microRNA，tRNA和tRFs&tiRNAs類群廣泛富集于各種生物體液中[3-4]。

圖1. tRFs&tiRNAs功能及相關(guān)疾病

    康成生物tRF&tiRNA測序服務(wù)提供從樣品到數(shù)據(jù)的全套解決方案。根據(jù)我們tRF&tiRNA測序和表達(dá)譜分析中得到的豐富信息，按照tRF&tiRNA：為什么以及如何研究它們？中提供的方法及應(yīng)用，科研工作者們能夠更便捷地推進(jìn)他們在這個新興領(lǐng)域的研究工作。

服務(wù)特色
•  性能優(yōu)化的測序方法與嚴(yán)格的質(zhì)控過程
•  使用Arraystar獨(dú)家授權(quán)的”tRF & tiRNA Analysis System”
      基于tRNA拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)和統(tǒng)計(jì)顯著性的精準(zhǔn)注釋與分類系統(tǒng)
       全面的tRFs&tiRNAs數(shù)據(jù)庫信息
       tRFs&tiRNAs專注的生物信息學(xué)與統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
•  額外的miRNA表達(dá)和差異分析
•  出版級的數(shù)據(jù)和圖表展示
•  無縫鏈接tRNA系列服務(wù)：tRNA-seq、tRF&tiRNA PCR array和 tRNA PCR array

生物信息學(xué)
   為了更好地了解tRFs及tiRNAs的生物學(xué)特征，促進(jìn)它們在生物標(biāo)志物方面的應(yīng)用，tRF&tiRNA-seq提供了豐富的生物信息學(xué)分析。額外福利：其他microRNA的表達(dá)分析也包含其中!

1.表達(dá)及差異表達(dá)譜

圖2. 表達(dá)及差異分析數(shù)據(jù)表
 
2.詳盡的注釋信息

圖3. 詳盡注釋的tRF&tiRNA序列、家族、二級結(jié)構(gòu)以及剪切位點(diǎn)
 
3. tRF&tiRNA在4種小RNA類型中的分布

圖4. tRF&tiRNA與其他相似尺寸小RNA之間的相對含量關(guān)系，在多種組織中，tRF&tiRNA的占較高甚至主要比例，這強(qiáng)烈預(yù)示了其重要的生理功能和生物標(biāo)志物應(yīng)用潛質(zhì)。
 

參考文獻(xiàn)
 1.Telonis A.G. et al. (2015) "Dissecting tRNA-derived fragment complexities using personalized transcriptomes reveals novel fragment classes and unexpected dependencies." Oncotarget 6(28):24797-822 [PMID: 26325506]
2.Olvedy M. et al. (2016) "A comprehensive repertoire of tRNA-derived fragments in prostate cancer." Oncotarget [PMID: 27015120]
3.Schageman J. et al. (2013) "The complete exosome workflow solution: from isolation to characterization of RNA cargo." Biomed Res Int 2013:253957 [PMID: 24205503]
4.Dhahbi J.M. et al. (2013) "5' tRNA halves are present as abundant complexes in serum, concentrated in blood cells, and modulated by aging and calorie restriction." BMC Genomics 14:298 [PMID: 23638709]